Ученые приближаются к карте иммунной системы млекопитающих

Используя искусственный интеллект, ученые из Юго-Западного Университета штата Калифорния определили тысячи генетических мутаций, которые могут повлиять на иммунную систему мышей. Работа является частью поисков одного из лауреатов Нобелевской премии по обнаружению практически всех подобных вариаций у млекопитающих.

Ученые приближаются к карте иммунной системы млекопитающих

«Это исследование идентифицирует 101 новый ген-кандидат с вероятностью более 95% того, что они необходимы для иммунитета», — говорит Брюс Бейтлер, доктор медицины, директор Центра генетики защиты хозяев и автор-корреспондент исследования, опубликованного на этой неделе в в Трудах Национальной академии наук. «Многие из этих кандидатов мы уже проверили, воссоздав мутации или выбив гены». Ведущий автор Даруи Сюй, вычислительный биолог из CGHD, написал программу.

«Мы разработали программное обеспечение под названием Candidate Explorer, которое использует алгоритм машинного обучения для выявления химически индуцированных мутаций, которые могут вызывать признаки, связанные с иммунитетом. Программное обеспечение определяет вероятность того, что любая вызванная нами мутация будет проверена как причинная после дальнейшее тестирование», — говорит Бейтлер. Его открытие важного семейства рецепторов, которые позволяют млекопитающим быстро уловить инфекцию и вызвать воспалительную реакцию, привело к Нобелевской премии по физиологии и медицине 2011 года.

«Цель CE — помочь исследователям предсказать, является ли мутация, связанная с фенотипом, действительно причинной мутацией. CE уже помогла нам идентифицировать сотни генов с новыми функциями в иммунитете. Это улучшит наше понимание система иммунная так, что мы можем найти новые способы, чтобы сохранить его надежным, а также знать причину иногда спотыкается», — говорит Бойтлера, Регенталь профессор, профессор иммунологии и внутренней медицины в Техасском.

«CE дает оценку, которая говорит нам о вероятности того, что конкретная ассоциация мутации и фенотипа будет проверена на предмет причинно-следственной связи, если мы воссоздадим мутацию или выбьем ген», — говорит он.

Источник — Газета Daily.

Газета «DAILY» — Новости Ростова-на-Дону